Από τότε ο πρόεδρος του ομίλου ΣΚΑΪ έχει επενδύσει περί τα 5 εκατομμύρια ευρώ στον ραδιοσταθμό (4.703.011 μόνο οι ΑΜΚ) για να φτάσει την συμμετοχή του στο 87,09%. Αρχικά καταβάλλοντας 2.000.005 ευρώ για τις μετοχές του Γιώργου Δήμα, νυν συνεργάτη του Βαγγέλη Μαρινάκη στην Alter Ego, της Θαναλε Α.Ε. που είναι μέτοχος στην «Οργανισμός Μέσων Μαζικής Επικοινωνίας Α.Ε.» μαζί με μια αύξηση μετοχικού κεφαλαίου. Την ίδια περίοδο προβαίνει στην πώληση του επιτυχημένου ροκ ραδιοσταθμού του, του Red 96.3, στην Αλεξάνδρα Δασκαλοπούλου.
Όταν ο Γιάννης Αλαφούζος ανέλαβε τον Σπορ FM, η συχνότητα δεν βρισκόταν στην καλύτερη οικονομική κατάσταση. Έκτοτε όμως, κι αφού μπήκε χρήμα στα ταμεία του, επέστρεψε το παραδοσιακό του όνομα χωρίς την χορηγία της Nova, άλλαξε εγκαταστάσεις και μετακόμισε από την Καλλιθέα «κατέβηκε» στο Μοσχάτο, λίγα μόνο μέτρα μακριά από τον ΣΚΑΪ, άλλαξε διευθυντή καθώς ανέλαβε ο Γιώργος Κοσμάς, ανανεώθηκε το image του με νέα σήματα και λογότυπο, έδιωξε πολλούς και έφερε άλλους τόσους στο πρόγραμμά του που άλλαξε εκ βάθρων.
Η «νέα εποχή» όμως επιφύλασσε και διάφορες αρνητικές εξελίξεις. Ως αποτέλεσμα της (τότε) μεγάλης κόντρας μεταξύ του Βαγγέλη Μαρινάκη και του Γιάννη Αλαφούζου, ο Σπορ FM υποχρεώθηκε να σταματήσει την μετάδοση των παιχνιδιών του Ολυμπιακού στο Καραϊσκάκης. Ενώ υπήρξαν αρκετά κρούσματα προπηλακισμών κι επιθέσεων από χούλιγκανς σε δημοσιογράφους του σταθμού.
Με δεδομένο το πωλητήριο στον Σπορ FM 94.6, ο όμιλος ΣΚΑΪ θα μείνει μόνο με δύο ραδιόφωνα. Τον ενημερωτικό ΣΚΑΪ 100.3 και το «μοναδικό κερδοφόρο μέσο» του, όπως είχε δηλώσει ο ίδιος ο Γιάννης Αλαφούζος, τον έντεχνο Μελωδία 99.2.
